PCR儀操作使用說明:
(一)試劑PCR儀
1.引物:決定擴增的特異性。根據檢測的DNA不同,選用不同引物,每種病原微生物都有自己特異的引物。
2.耐熱的DNA聚合酶:此酶是從耐熱細菌中分離出來的,能耐受高溫90℃-100℃。
3.10×PCR緩沖液:500mmol/l KCl;100mmol/L Tris-HCl(pH8.4,20℃)150mmol/L MgCl2,1mg/ml明膠。10×PCR緩沖液隨酶一起購買。
4.5mmol/L dNTP貯備液:將dATP、dCTP、dGTP和dTTP鈉鹽各100mg合并,加入滅菌去離子水溶解,用NaOH調pH至中性,分裝每份300μl,-20℃保存。dNTP濃度用UV吸收法測定。現用dNTP溶液均有商品化產品。
5.DNA模板:用處理液將待測標本處理,不同處理方法、操作各異,但目的是暴露標本中被檢測的DNA。
(二)操作程序PCR儀
過去標準的PCR操作程序是將PCR儀必需反應成份分別加入一微量離心管中,然后置于一定的循環參數條件下進行循環擴增。具體如下:
1.向一微量離心管中依次加入
DNA模板 102-105拷貝
引物 各1μmol/L
dNTP 各200μmol/L
10×PCR緩沖液 1/10體積
ddH2O 補到終體積(終體積50μl-100μl)
混勻后,離心15s使反應成分集于管底。以上步驟僅在實驗研究用,現在商品化試劑已將dNTP、10×PCR緩沖液,引物,ddH2O混合在一起,反應體積為20-25μl,只要試驗人員加入處理好的樣品就可以了。
2.加石蠟油50-100μl于反應液表面以防蒸發。置反應管于97℃變性10min。
3.冷至延伸溫度時,加入1-5u Taq DNA聚合酶,離心30s使酶和反應液充分混合。現在臨床使用試劑酶通常已加入反應液中。
4.PCR儀的循環程序為:94℃變性30s,55℃退火20s,然后在72℃延伸30s,共循環30-35次。較為后一次循環結束后,再將反應管置72℃溫育5min,以確保充分延伸。
PCR儀尚可用于組織標本DNA的擴增。由于固定組織標本的DNA常發生降解,就給常用的分析方法如Southern轉印雜交等帶來一定困難。
在應用PCR方法檢測RNA病毒時,首先應將RNA轉化成cDNA才能進行擴增,因為PCR只能對DNA模板進行擴增,我們把這種RNA的PCR反應稱為反轉錄PCR,簡稱RT-PCR。把由RNA轉化成DNA的過程叫做反轉錄,反轉錄需要在反轉錄酶的作用下完成。
PCR儀使用注意事項:
1. PCR基因擴增儀應放置在水平堅固的平臺上,外界電源系統電壓要匹配,并要求有良好的接地線。
2.環境溫度保持在23℃左右,濕度保持在60%左右。
3.應配備功率≥3000W的穩壓器。
4.應定期清潔維護。
5.使用時應嚴格遵守上述使用步驟。
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